Entre el 8 y el 10 de diciembre de 1977, un Grupo de Tareas de la Marina ejecutó el secuestro de doce personas que se reunían en la iglesia para organizar el reclamo por sus familiares desaparecidos.
Este operativo fue facilitado por la infiltración del entonces capitán de fragata Alfredo Astiz en el el grupo. Las personas secuestradas fueron conducidas al centro clandestino de detención que funcionaba en la Escuela de Mecánica de la Armada (ESMA) y posteriormente arrojadas vivas al mar, en los llamados vuelos de la muerte.
Entre ellas estaban Azucena Villaflor de Devincenti, Esther Ballestrino de Careaga y María Eugenia Ponce de Bianco, integrantes de Madres de Plaza de Mayo, las monjas francesas Leònie Douquet y Alice Domon y la militante Angela Auad.
Los cuerpos de la mayoría de quienes integraban el grupo nunca fueron hallados, excepto los restos de las Madres, de Douquet y de Auad, que fueron identificados por el Equipo Argentino de Antropología Forense (EEAF) en 2005.
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